财政部台北国税局表示，货运业者因承揽运送货物途中货物不慎破损而赔偿货主损失，其运费收入不得以扣除赔偿款后之金额开立统一发票。

该局说明，依加值型及非加值型营业税法第1条及第16条规定，在中华民国境内销售货物或劳务及进口货物，均应依法课征营业税；销售额为营业人销售货物或劳务所收取之全部代价，包括营业人在货物或劳务之价额外收取之一切费用。所以，营业人如因销售​​货物或劳务衍生取得赔偿款者，必须开立统一发票报缴营业税，反之，如果是因进货行为而取得赔偿款者，则非属营业税课征范围。

该局举例说明，货运业者甲公司承揽运送货物予货主乙公司，双方约定收取运费10,000元，甲公司因于运送途中货物不慎破损需赔偿乙公司损失2,000元。乙公司系购买运送劳务者，其取得赔偿款2,000元部分，与销售货物或劳务无关，非属营业税课税范围，乙公司无需开立统一发票予甲公司；甲公司赔付乙公司公司2,000元部分，不得以销货退回与折让抵减销售金额，仍应就运费收入10,000元开立统一发票并报缴营业税。

该局提醒，货运业者如有赔偿货主损失时，不得以抵付货主损失后之余额开立发票，仍应以货运收入金额依法开立统一发票并报缴营业税，以免遭补税处罚。